染色質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)對(duì)于真核生物基因組穩(wěn)定性與基因表達(dá)調(diào)控有著重要作用。近年來(lái)，隨著高通量染色質(zhì)構(gòu)象捕獲技術(shù)（Hi-C）等前沿技術(shù)的突破性發(fā)展，植物全基因組染色質(zhì)相互作用的研究取得了顯著進(jìn)展。這些研究不僅揭示了植物染色質(zhì)在細(xì)胞核內(nèi)的空間排布規(guī)律，更為解析植物響應(yīng)環(huán)境脅迫的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制、發(fā)育程序的時(shí)空特異性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了全新的研究視角。

2025年3月16日，基因功能研究與操控全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院、北京大學(xué)-清華大學(xué)生命科學(xué)聯(lián)合中心周岳課題組受邀在Cell Press旗下學(xué)術(shù)期刊STAR Protocols雜志在線發(fā)表題為“Protocol for capturing genome-wide chromatin interactions in Arabidopsis”的實(shí)驗(yàn)方案類文章。文章詳細(xì)介紹了捕獲擬南芥全基因組染色質(zhì)相互作用的實(shí)驗(yàn)方案。

該方案以擬南芥為實(shí)驗(yàn)材料，詳細(xì)介紹了交聯(lián)固定、細(xì)胞核分離、染色質(zhì)酶切和連接、解交聯(lián)和DNA提取、DNA片段化并分選、生物素富集和文庫(kù)構(gòu)建等步驟。周岳團(tuán)隊(duì)已運(yùn)用本方案進(jìn)行了擬南芥染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的多角度研究，相關(guān)研究成果已發(fā)表于Molecular Cell、Plant Cell、Genome Biology等多個(gè)期刊。此外，該方案目前已被證實(shí)在大豆、小麥、玉米等作物的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)研究中同樣可行。

基因功能研究與操控全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院、北京大學(xué)-清華大學(xué)生命科學(xué)聯(lián)合中心周岳研究員為本文通訊作者，北京大學(xué)前沿交叉學(xué)科研究院博士生舒家悅為本文第一作者。該研究得到科技創(chuàng)新2030重大項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)科學(xué)院青年交叉團(tuán)隊(duì)、基因功能研究與操控全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院、北京大學(xué)-清華大學(xué)生命科學(xué)聯(lián)合中心的資助。