PNAS | 北京大學(xué)鄧興旺團(tuán)隊(duì)與中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)合作揭示水楊酸信號(hào)參與植物光形態(tài)建成調(diào)控的新機(jī)制

植物作為定植生物,與動(dòng)物不同,無(wú)法主動(dòng)避開(kāi)不利的環(huán)境因素,因此,它們必須不斷應(yīng)對(duì)由生物和非生物因素引起的環(huán)境變化。如何精準(zhǔn)且有效地應(yīng)對(duì)這些挑戰(zhàn),是植物生存與繁衍的核心課題之一。光照作為植物生長(zhǎng)和發(fā)育的關(guān)鍵環(huán)境信號(hào),在其生命周期中發(fā)揮著決定性作用。同時(shí),植物激素作為內(nèi)源性調(diào)節(jié)因子,在植物適應(yīng)光環(huán)境、完成光形態(tài)建成的過(guò)程中,扮演著不可或缺的角色。

當(dāng)植物遭遇病原菌侵襲時(shí),會(huì)迅速啟動(dòng)免疫防御機(jī)制,并合成大量水楊酸(Salicylic AcidSA),以增強(qiáng)免疫反應(yīng)。然而,免疫反應(yīng)是一個(gè)能量密集型過(guò)程,通常會(huì)抑制植物的正常生長(zhǎng)。因此,如何在免疫反應(yīng)與正常生長(zhǎng)之間找到平衡,一直是植物學(xué)研究中的重要議題。盡管現(xiàn)有研究已廣泛探討了植物激素在光形態(tài)建成中的作用,水楊酸作為植物免疫激素在這一過(guò)程中所發(fā)揮的作用仍未得到足夠關(guān)注。

水楊酸的受體NPR1NONEXPRESSER OF PATHOGENESIS-RELATED GENES 1)是水楊酸信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的關(guān)鍵調(diào)控因子,在植物免疫反應(yīng)中發(fā)揮著核心作用。然而,植物如何整合光信號(hào)與水楊酸信號(hào)以應(yīng)對(duì)復(fù)雜的環(huán)境變化,以及水楊酸在光形態(tài)建成中的作用仍未得到深入和系統(tǒng)的研究。同時(shí),NPR1在光形態(tài)建成中的作用機(jī)制也尚不明晰。深入研究水楊酸及其受體NPR1在植物光形態(tài)建成中的角色,不僅有助于揭示植物如何協(xié)調(diào)免疫反應(yīng)與生長(zhǎng)發(fā)育之間的關(guān)系,也為理解植物如何適應(yīng)動(dòng)態(tài)變化的環(huán)境提供了重要的科學(xué)依據(jù)。

在植物光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控中,光敏色素相互作用因子(Phytochrome Interacting Factors, PIFs)是重要的轉(zhuǎn)錄因子。在光照條件下,PIFs通過(guò)泛素化途徑迅速降解,以精確響應(yīng)光信號(hào);這一精細(xì)的調(diào)控機(jī)制確保了植物能夠在動(dòng)態(tài)變化的光環(huán)境中準(zhǔn)確做出適應(yīng)性調(diào)整。然而,盡管已有研究揭示了其 PIFs 穩(wěn)定性調(diào)控的泛素連接酶,但PIF4 蛋白穩(wěn)定性調(diào)控的具體機(jī)制仍不清楚,亟待進(jìn)行深入和系統(tǒng)的研究,揭示其背后的分子機(jī)制及生物學(xué)意義。

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近日,北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院/北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院/濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室/小麥育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室鄧興旺教授團(tuán)隊(duì)與中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院楊麗教授團(tuán)隊(duì)合作,在《美國(guó)科學(xué)院院刊》(PNAS)在線發(fā)表了題為《NPR1 promotes blue light-induced plant photomorphogenesis by ubiquitinating and degrading PIF4》的研究論文。該研究揭示了水楊酸通過(guò)NPR1-PIF4信號(hào)模塊促進(jìn)植物光形態(tài)建成。研究發(fā)現(xiàn),在藍(lán)光條件下,水楊酸受體NPR1作為CUL3依賴(lài)性E3泛素連接酶,介導(dǎo)PIF4的翻譯后調(diào)控。具體而言,NPR1促進(jìn)了PIF4的泛素化,并通過(guò)26S蛋白酶體途徑在細(xì)胞核中降解PIF4,從而顯著降低了藍(lán)光條件下PIF4的蛋白水平,抑制了植物胚軸的伸長(zhǎng)。此外,藍(lán)光受體隱花色素(Cryptochrome, CRYs)通過(guò)促進(jìn)NPR1PIF4的相互作用及其泛素化,進(jìn)一步增強(qiáng)了這一過(guò)程。這項(xiàng)研究不僅揭示了NPR1在植物光形態(tài)建成中的新角色,還闡明了其在藍(lán)光響應(yīng)中的獨(dú)特調(diào)控機(jī)制,為植物如何平衡免疫反應(yīng)與生長(zhǎng)發(fā)育提供了新的分子機(jī)制和理論依據(jù)。揭示了此前未知的在藍(lán)光條件下對(duì)PIF4進(jìn)行翻譯后調(diào)控的機(jī)制,豐富了我們對(duì)植物光形態(tài)建成的理解,也為未來(lái)相關(guān)研究提供了新的視角。

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1. 水楊酸通過(guò)NPR1-PIF4信號(hào)模塊促進(jìn)植物光形態(tài)建成

該研究首先對(duì)水楊酸處理?xiàng)l件下的野生型(Col-0)擬南芥幼苗下胚軸長(zhǎng)度進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果顯示水楊酸顯著抑制了擬南芥下胚軸的伸長(zhǎng),即促進(jìn)植物光形態(tài)建成。隨后,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)不同基因型的擬南芥幼苗(包括pif4-2, 35S::PIF4-MYC, npr1-1, 以及35S::NPR1-GFP npr1-1)在水楊酸處理下的下胚軸長(zhǎng)度進(jìn)行了進(jìn)一步分析。結(jié)果表明,NPR1PIF4共同參與了水楊酸對(duì)擬南芥下胚軸伸長(zhǎng)的調(diào)控(圖1)。此外,通過(guò)比較不同單色光條件下npr1-1Col-0的下胚軸長(zhǎng)度,以及Col-0npr1-135S::NPR1-GFP npr1-1的子葉面積,發(fā)現(xiàn)NPR1在藍(lán)光條件下正向調(diào)控植物的光形態(tài)建成(圖2A, B)。

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2. NPR1通過(guò)PIF4直接互作正調(diào)控藍(lán)光光形態(tài)建成

研究進(jìn)一步表明,NPR1通過(guò)與PIF4直接互作來(lái)正向調(diào)控光形態(tài)建成。具體而言,NPR1PIF4在細(xì)胞核內(nèi)發(fā)生相互作用,并且在體外也能夠直接結(jié)合。免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證了NPR1PIF4在體內(nèi)的相互作用,并且藍(lán)光處理能夠顯著增強(qiáng)這種相互作用(圖2C-H)。通過(guò)分析pif4 npr1雙突變體與pif4單突變體的表型相似性,研究發(fā)現(xiàn)NPR1通過(guò)PIF4正向調(diào)控藍(lán)光引發(fā)的植物光形態(tài)建成(圖2I)。

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3. NPR1直接泛素化PIF4通過(guò)26S蛋白酶體將其降解

該研究還發(fā)現(xiàn),NPR1能夠直接泛素化PIF4Lys129/252/428氨基酸殘基,從而負(fù)向調(diào)控PIF4的蛋白穩(wěn)定性。通過(guò)將PIF4的泛素化位點(diǎn)突變體PIF4(3KR)回補(bǔ)到pif4-2突變體中,研究發(fā)現(xiàn),在暗轉(zhuǎn)藍(lán)光條件下,PIF4(3KR)蛋白比野生型PIF4更為穩(wěn)定。此外,PIF4pro:PIF4(3KR)-MYC pif4-2下胚軸長(zhǎng)度顯著長(zhǎng)于野生型,這一表型與npr1-1相似,表明NPR1通過(guò)泛素化PIF4參與藍(lán)光下的光形態(tài)建成。同時(shí),PIF4pro:PIF4(3KR)-MYC pif4-2的下胚軸伸長(zhǎng)對(duì)水楊酸處理不再敏感,進(jìn)一步證明水楊酸對(duì)下胚軸伸長(zhǎng)的抑制作用依賴(lài)于NPR1對(duì)PIF4的泛素化調(diào)控(圖3)。

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4. NPR1對(duì)PIF4蛋白的調(diào)控具有藍(lán)光特異性,且該過(guò)程由藍(lán)光受體CRY介導(dǎo)

通過(guò)檢測(cè)暗轉(zhuǎn)不同單色光PIF4蛋白水平,研究發(fā)現(xiàn),在藍(lán)光條件下,npr1-1突變體中PIF4蛋白的穩(wěn)定性顯著提高,表明NPR1對(duì)PIF4蛋白穩(wěn)定性的泛素化調(diào)控具有藍(lán)光特異性。進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在藍(lán)光條件下,NPR1能夠促進(jìn)PIF4的泛素化。此外,研究還發(fā)現(xiàn),藍(lán)光受體隱花色素(CRYs)能增強(qiáng)NPR1PIF4之間的相互作用,且CRY1進(jìn)一步促進(jìn)NPR1通過(guò)泛素化途徑降解PIF4 這些結(jié)果揭示了NPR1通過(guò)泛素化調(diào)控PIF4蛋白,特異性地調(diào)控?cái)M南芥藍(lán)光誘導(dǎo)的光形態(tài)建成過(guò)程(圖4

總體而言,本研究成功揭示了NPR1在植物光形態(tài)建成中的新角色,極大拓展了我們對(duì)植物生長(zhǎng)調(diào)控機(jī)制的理解。尤其值得注意的是,研究首次發(fā)現(xiàn)了一種在藍(lán)光條件下對(duì)PIF4進(jìn)行翻譯后調(diào)控的全新機(jī)制。這一新機(jī)制在植物發(fā)育的精細(xì)調(diào)控中具有重要意義通過(guò)精確調(diào)控PIF4,植物能夠根據(jù)藍(lán)光信號(hào)的變化,靈活調(diào)整自身的生長(zhǎng)發(fā)育,從而更好地適應(yīng)外界環(huán)境的動(dòng)態(tài)變化,如光照強(qiáng)度、光周期和溫度波動(dòng)等。這種適應(yīng)性調(diào)節(jié)不僅幫助植物在競(jìng)爭(zhēng)激烈的自然環(huán)境中獲取更多的生存資源(如光能、水分和養(yǎng)分),還增強(qiáng)了其應(yīng)對(duì)各種生物和非生物脅迫的能力,確保植物能夠在復(fù)雜多變的環(huán)境中生存繁衍。

論文的通訊作者為中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院楊麗教授和北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院、北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院鄧興旺院士。論文第一作者為北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院博士后、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院訪問(wèn)學(xué)者周楊楊。中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)李繼剛教授和北京大學(xué)何光明副研究員也參與了該項(xiàng)研究工作。該工作得到北京市自然科學(xué)基金, 國(guó)家自然科學(xué)基金,拼多多-中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)研究基金, 中國(guó)高校科研基金, 國(guó)家高層次青年人才項(xiàng)目, 中國(guó)科協(xié)青年人才托舉工程項(xiàng)目, 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)2115人才發(fā)展計(jì)劃;國(guó)家自然科學(xué)基金重大研究計(jì)劃項(xiàng)目, 山東省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等多個(gè)科研項(xiàng)目的資助。

論文鏈接:https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2412755121

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